メインライブラリー
手前には白を基調とした光溢れる空間があり、花梨やアオダモが花や実をつける様子が見られます。奥には黒を基調にした静寂な空間があり書庫が置かれています。アート・建築・デザイン ・工芸・文学書などが集められています。
フォレストライブラリー
山庭の樹木や苔を間近に眺められるライブラリーです。樹齢数百年の樹木が生い茂る歴史ある山庭を守り、次世代に引き継いでいくために、このライブラリーは創られました。山庭の豊かな自然に暖かく包まれる安らぎの時間をお過ごしください。書庫には、日本の樹木や植物、苔などに関する書籍が集められています。
ライブラリーゼロ
広大な空間に、アートスペースと書庫を備えています。アートスペースには「ゼロの転位 Replacement of Zero」 を展示。現代アーティスト宮島達男氏とべにや無何有設計者の建築家竹山聖氏による作品です。書庫には、ゼロ・無・空などをテーマにした哲学・数学・美術などに関する書籍が集められています。